Mergupe ir Lielās Juglas kreisā satekupe Amatas, Siguldas un Mālpils novados. Iztek no nelielā Būnēnu ezera Nītaures pagastā. Augštece līdz Brendupes ietekai saukta par Būnēnu strautu. Sākumposmā ~2 km garumā upe regulēta. Līdz Nītaurei Mergupe tek pa izteiktu ieleju mežainā apvidū. Pēc Nītaures upe nonāk līdzenā purvainā apvidū, kur tā uzņem apkārtējo meliorēto platību drenāžas ūdeņus. Lejpus Moresmuižas līkumo pa izteiktu ieleju. Pie Sidgundas satek ar Sudu, izveidojot Lielo Juglu.